Kondisi lintasan membaik saat sesi siang, meski masih ada awan kelabu. Temperatur lintasan lebih tinggi dan jejak basah sudah mengering. Andrea Iannone tidak fit karena cedera pada jari kaki kanannya. Pada awalnya, Scott Redding dan Sam Lowes mengambil posisi teratas. Namun, Toprak Razgatlioglu mampu mendominasi dengan catatan waktu tercepat. Dia harus bersaing dengan Danilo Petrucci dan Lowes untuk mempertahankan posisinya.
Selama 10 menit pertama, Axel Bassani berhasil naik ke tiga besar, menggeser posisi Lowes. Nicolo Bulega dan Andrea Locatelli yang mengalami kecelakaan di FP1, kembali ke lintasan dan menunjukkan performa yang solid. Di pertengahan sesi, Alvaro Bautista mulai menunjukkan kekuatannya dengan menduduki posisi ketiga setelah start dari posisi ke-20. Namun, Alex Lowes berhasil menggesernya ke posisi keempat.
Redding menjadi pembalap pertama yang terjatuh dalam sesi tersebut. Pada 10 menit terakhir, para pembalap menekan gas motornya. Namun, Razgatlioglu dan Lowes masih unggul, diikuti oleh pasangan Aruba.it, Bulega dan Bautista. Danilo Petrucci, Michael van der Mark, Andrea Locatelli, Bassani, Xavi Vierge juga masuk dalam 10 besar. Jonathan Rea kembali bersaing di papan tengah setelah comeback di WSBK Italia.
Setelah bendera dikibarkan, posisi 10 besar hanya mengalami sedikit perubahan, di mana Bassani berhasil naik ke posisi tujuh. Hasil FP2 WSBK Republik Ceko menunjukkan dominasi Razgatlioglu dengan kompetisi ketat dari Lowes bersaudara, Sam dan Alex.
