Pembalap CFMoto Aspar Team sukses meraih pole position dan kemenangan di Circuit de Barcelona-Catalunya, dan kembali mendominasi kualifikasi di Misano. Dengan waktu 1:34,216 di Q2, ia berhasil mengungguli pesaing seperti Vietti dan ManuGas. Kualifikasi Moto2 di Misano dipengaruhi oleh cuaca panas meskipun ada beberapa awan, dengan suhu mendekati 30º C. Sebanyak 16 pembalap turut ambil bagian dalam Q1, termasuk Aron Canet, Dani Munoz, dan Tony Arbolino. Arbolino berhasil meraih posisi pertama dengan waktu 1:34,981 di depan Ivan Ortola dan Darryn Binder, diikuti oleh Collin Veijer, Ayumu Sasaki, dan Marcos Ramirez di Q2.
Dengan ban baru, Arbolino dan Canet menunjukkan peningkatan performa yang signifikan, dengan Arbolino memimpin klasemen. Diogo Moreira juga berhasil menunjukkan permainan kuatnya dengan waktu terbaik di akhir sesi. Posisi terdepan di Misano disegel oleh David Alonso, meskipun kemudian disalip oleh Diogo Moreira. Namun, Arbolino mampu merebut kembali posisi teratas sebelum pergantian ban dan memecahkan rekor dengan waktu 1:34,420. Dengan ban baru, klasifikasi kembali berubah, dengan Dani Holgado menjadi pembalap tercepat di Q2, diikuti oleh Manu Gonzalez dan Aron Canet.
Dengan hasil kualifikasi tersebut, Holgado berhasil mendominasi pole position di Misano setelah meraih kemenangan di Barcelona. Vietti, Barry Baltus, Canet, dan Moreira menyusul di barisan kedua. Sisa grid diisi oleh pembalap seperti Senna Agius, Jake Dixon, dan Albert Arenas. Dengan demikian, kualifikasi Moto2 San Marino menegaskan performa gemilang dari para pembalap yang berhasil meraih posisi terdepan di balapan nanti.
